Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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NYXQ9GZU5 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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NYXQ9GZU5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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NYXQ9GZU5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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NYXQ9GZU5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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NYXQ9GZU5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NYXQ9GZU5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms