Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRIP3Q9BW71 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms