Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOXF2Q9BQY4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms