Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLF1Q9BQI6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms