Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGD4Q96M96 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms