Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COG3Q96JB2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms