Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2Q8WZ74 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms