Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TMIEQ8NEW7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms