Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC112Q8NEF3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms