Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P3H3Q8IVL6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms