Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms