Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms