Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms