Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC27A3Q5K4L6 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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