Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL24A1Q17RW2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms