Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAPSQ13938 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAPSQ13938 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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