Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms