Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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