Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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