Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLFQ13129 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms