Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD4Q12950 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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