Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
STX4Q12846 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms