Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SCN1BQ07699 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms