Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSC2Q02487 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms