Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIRAP54198 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIRAP54198 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIRAP54198 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms