Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms