Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMARCA2P51531 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms