Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSFP46459 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSFP46459 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSFP46459 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSFP46459 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSFP46459 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSFP46459 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSFP46459 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSFP46459 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSFP46459 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSFP46459 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSFP46459 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms