Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP1P29466 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms