Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARID4AP29374 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms