Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRMP28827 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRMP28827 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRMP28827 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPRMP28827 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRMP28827 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PTPRMP28827 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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