Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PSMA1P25786 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms