Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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NFKB1P19838 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFKB1P19838 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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