Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBTFP17480 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBTFP17480 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBTFP17480 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBTFP17480 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBTFP17480 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms