Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA1P17302 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA1P17302 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA1P17302 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA1P17302 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA1P17302 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA1P17302 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GJA1P17302 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GJA1P17302 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms