Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

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Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEFHP12036 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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