Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK4P11802 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK4P11802 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK4P11802 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK4P11802 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK4P11802 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK4P11802 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK4P11802 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK4P11802 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms