Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SFTPCP11686 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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