Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms