Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TMEM225BP0DP42 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMEM225BP0DP42 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMEM225BP0DP42 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMEM225BP0DP42 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMEM225BP0DP42 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TMEM225BP0DP42 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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