Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFNB1P01574 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms