Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms