Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARNTLO00327 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms