Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GOLGA8SH3BPF8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms