Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGPD3A6NKT7 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms