Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms