Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S4R3C0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S4R3C0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S4R3C0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S4R3C0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S4R3C0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
S4R3C0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S4R3C0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S4R3C0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S4R3C0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
S4R3C0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
S4R3C0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S4R3C0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
S4R3C0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
S4R3C0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
S4R3C0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
S4R3C0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
S4R3C0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
S4R3C0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
S4R3C0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
S4R3C0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S4R3C0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S4R3C0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S4R3C0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S4R3C0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
S4R3C0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
S4R3C0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
S4R3C0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
S4R3C0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
S4R3C0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
S4R3C0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
S4R3C0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
S4R3C0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
S4R3C0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
S4R3C0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
S4R3C0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
S4R3C0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
S4R3C0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms