Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN6Q9Y6Q1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN6Q9Y6Q1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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