Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00312Q9Y6C7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00312Q9Y6C7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms