Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNPO3Q9Y5L0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNPO3Q9Y5L0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms